Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique H/F

Offre de mobilité interne réservée exclusivement aux titulaires et CDI CNRS

Candidatez avant mardi 16 janvier sur https://emploi.cnrs.fr/Offres/MOBINT/UMR7216-MOBINT-I53010/Default.aspx

 

Missions

L’ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique a la responsabilité de la plateforme enSCORE, partagée entre l’EDC et l’Institut Jacques Monod (IJM), localisée à l’IJM et dédiée à de la différentiation en organoïdes de lignées de cellules humaines induites à la pluripotence (hiPSCs). Dans ce cadre, il/elle assure la conception, le développement, et la conduite des projets de cette plateforme. Elle/il assure la veille technologique et l’application des méthodes pour la modification génétique des hiPSCs, leur différenciation, notamment en organoïdes cérébraux et spinaux, la culture des cellules différenciées,
leur contrôle qualité et leur analyse principalement par des techniques d’imagerie (immunocytochimie, FACS), de transcriptomique ou de protéomique. Elle/il est chargé.e de former les utilisateurs des équipes à la culture des iPSCs et la production les organoïdes et à les accompagner dans l’adaptation et le développement de protocoles et l’analyse phénotypique.

Activités

– Concevoir et conduire des développements technologiques mutualisés et innovants, en relation avec les projets des utilisateurs ou partenaires, en particulier pour la génération par édition du génome de nouvelles lignées d’hiPSC et leur différenciation en organoïdes, notamment (mais pas exclusivement) cérébraux et spinaux.
– Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d’activité
– Coordonner la mise en place des méthodes et l’organisation des activités
– Contrôler la qualité des lignées d’IPScs et des organoïdes obtenus et des procédures utilisées
– Participer aux décisions techniques liés aux projets de recherche des équipes, notamment celles localisées à l’IJM) et l’Unité Epigénétique et Destin Cellulaire (EDC).
– Animer la plateforme en étroite interaction avec le(s) responsable(s) scientifique(s)
– Conseiller les utilisateurs et les partenaires sur les possibilités et limites des techniques disponibles, sur l’interprétation des données
– Accompagner et aider les étudiants, les post-doctorants et les collaborateurs pour l’élaboration et la conduite de protocoles expérimentaux; aider les équipes situées à l’Institut Cochin qui le souhaitent à implémenter ces approches sur leur site.
– Assurer certaines tâches administratives (commandes, gestion de stocks, organisation de plannings, etc.)
indispensables au fonctionnement de la plateforme

Autres activités :
– Concevoir et animer des actions de formation
– Interagir avec les autres plateformes (notamment dans le contexte du GDR organoides (CNRS GDR2102)
– Participer à la rédaction de dossiers scientifiques et techniques dans le cadre de demandes de financement ou de rapports d’activité
– Appliquer et faire appliquer en situation de travail les réglementations du domaine, en matière d’éthique, d’hygiène et de sécurité et de bonnes pratiques de laboratoire
– Piloter la mise en place d’une démarche qualité

Compétences

Connaissances:
– Maîtrise des protocoles de culture de cellules souches pluripotentes.
– Capacité à caractériser ces cellules et leurs dérivés neuronaux par des proches classiques d’imagerie, de génétique
moléculaire.
– Connaissances en biologie cellulaire et culture cellulaire
– Connaissances de base en sciences de la vie et en biologie moléculaire
– Expression et compréhension orale et écrite en anglais (niveau 2)

Compétences opérationnelles :
– Maîtrise des méthodologies de gestion de projet
– Capacité à évaluer et garantir la qualité et la pertinence des processus et protocoles de culture et de stockage de cellules souches pluripotentes, et leur traçabilité
– Aide à la mise à disposition sous forme de banque de cellules et des outils développés (protocoles)
– Capacité à assurer le suivi et la valorisation de la mise à jour de ces outils et méthodes d’analyse, liste de réactifs ad hoc actualisées et des anticorps pertinents pour l’analyse)
– Capacité à intervenir dans des séminaires internes à la plateforme et les réunions concernant les projets des équipes associées à la plateforme
– Capacités à interagir avec les autres ingénieurs de la plateforme ou des autres plateformes mentionnées ci-dessus

Savoirs être :
– Rigueur, autonomie, dynamisme, réactivité
– Bonne capacité à travailler en équipe
– Savoir respecter les calendriers et les consignes

Contexte de travail

Créée début 2021 avec le soutien du labex « Who Am I » sur un projet structurant, la plateforme enSCORE est hébergée au sein de l’Institut Jacques Monod (IJM) (https://www.ijm.fr) et codirigée par l’IJM et l’Unité Épigénétique et Destin (EDC). L’IJM, unité de recherche mixte CNRS/Université Paris Cité accueille près de 30 équipes de recherches, dont au moins 4 travaillent actuellement avec des cellules souches pluripotentes et 3 sont impliquées à l’EDC. Son fonctionnement repose sur deux laboratoires de niveau L2 situés au 3ème étage de l’IJM, et bénéficie de l’accès à des locaux expérimentaux et bureaux, et aux plateformes complémentaires de l’IJM (plateforme ImagoSeine; plateau technique d’histologie). De plus, enSCORE est à proximité de plateformes localisées au sein de l’unité de recherche EDC (plateforme GENIE, dédiée à l’édition du génome et de l’épigénome, Plateforme de Vectorologie équipée d’un laboratoire L3, qui participent à l’ingénierie des (épi)génomes des cellules souches issues de donneurs sains ou de patients, et la plateforme Epi2 de microscopie multiparamétrique, en live, et haut débit (Operetta).