H/F postdoctorant.e en biophysique de l’infection bactérienne

Missions

Le/la candidat·e étudiera l’implication des forces mécaniques dans le processus d’infection bactérienne, en cherchant à comprendre comment les bactéries pathogènes détectent et réagissent à ces forces, mais également comment leurs interactions avec les cellules et tissus hôtes influencent la mécanique et la physiologie des tissus barrières.
Pour mener à bien ce projet, le/la candidat·e réalisera des expériences d’imagerie dynamique à l’aide d’un microscope à disque tournant (Spinning Disk) disponible dans l’équipe, combinées à des analyses d’image à l’aide des logiciels Fiji, Matlab et Python. Ces approches seront complétées par des outils classiques de microbiologie (préparation de souches fluorescentes et de mutants de Neisseria meningitidis), de biologie cellulaire (lignées cellulaires humaines, perturbations chimiques et génétiques de protéines d’intérêt), ainsi que de microfabrication (photolithographie, modification des substrats d’adhésion, microfluidique).
Des collaborations au sein de l’institut seront établies afin d’associer ces approches à des mesures directes des forces mécaniques à différentes échelles.

Activités

• Imagerie dynamique sur microscope confocal à fluorescence de type Spinning Disk
• Analyse d’image à l’aide des logiciels Fiji, Python et Matlab
• Culture cellulaire de lignées et de cellules primaires ; techniques standard de biologie cellulaire : immunofluorescence, transfection, siRNA, Western blot
• Culture bactérienne, biologie moléculaire et approches génétiques pour la génération de souches d’intérêt
• Approches biophysiques pour moduler l’environnement chimique et mécanique des cellules infectées : 1) Fabrication et utilisation de puces microfluidiques; 2) Conception d’hydrogels pour des expériences de Traction Force Microscopy; 3) Préparation de substrats adhésifs à géométrie contrôlée via micropatterning
• Analyse quantitative des données expérimentales

Compétences

Des compétences en biologie cellulaire, biophysique ou microbiologie sont particulièrement appréciées.
Une expérience en microscopie et analyse d’image, ou en microfabrication, constitue un atout.

Contexte de travail

Le projet se déroulera au sein de l’équipe de Daria Bonazzi à l’Institut Jacques Monod. Cette équipe récemment créée rassemble des biophysiciens et des biologistes passionnés par la mécanobiologie des infections bactériennes. Ce projet offrira une excellente opportunité de développer des collaborations étroites avec les équipes voisines, qui disposent d’expertises et d’outils expérimentaux très complémentaires, notamment en physique de la matière active, biophysique du cytosquelette, et mécanotransduction dans des modèles eucaryotes.

Contraintes et risques

Risque biologique (manipulation des bactéries pathogènes de niveau 2, obligation de rappel vaccinal contre le méningocoque ACWY).