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Ingénieur de recherche (H/F) en apprentissage automatique appliqué à la génomique évolutionnaire

Candidatez sur le portail emploi CNRS avant le 30 mars

Description du Poste

Les Missions

Le/la candidat·e sera recruté.e dans le cadre d’un projet financé par la Fondation pour la Recherche Médicale visant à caractériser l’origine évolutive des maladies génétiques complexes humaines à partir de données génomiques anciennes et modernes.
La mission consistera à concevoir et développer une méthode d’apprentissage automatique destinée à inférer des paramètres évolutionnaires à partir de données génomiques anciennes et modernes à grande échelle. Le poste implique une contribution directe à la définition du cadre méthodologique, à l’implémentation des modèles, ainsi qu’à leur validation sur données simulées et empiriques.
Le ou la candidat·e travaillera à l’interface entre génétique évolutionnaire, modélisation statistique et apprentissage automatique, en collaboration étroite avec les membres de l’équipe.

L’Activité

• Conception et développement d’une méthode d’apprentissage automatique pour l’inférence de paramètres évolutionnaires
• Implémentation et optimisation d’algorithmes adaptés à des jeux de données génomiques à grande échelle
• Développement de stratégies de validation sur données simulées et réelles
• Intégration de la méthode dans un environnement de calcul reproductible
• Participation aux discussions méthodologiques et à la valorisation scientifique des développements

Votre Profil

Compétences

Compétences techniques :
• Formation en apprentissage automatique, statistiques, bioinformatique, génomique computationnelle ou discipline apparentée
• Expérience en développement d’algorithmes ou de modèles statistiques
• Maîtrise de Python (frameworks ML appréciés : PyTorch, TensorFlow, scikit-learn)
• Maîtrise des environnements Unix/Linux
• Expérience en traitement de données à grande échelle

Compétences transversales :
• Capacité à travailler de manière autonome sur un développement méthodologique
• Esprit analytique et rigueur scientifique
• Capacité à interagir avec des chercheurs issus de disciplines différentes
• Bonne maîtrise de l’anglais scientifique

Votre Environnement de Travail

Le projet se déroulera au sein de l’équipe de Stéphane Peyrégne à l’Institut Jacques Monod. Cette équipe récemment créée étudie les génomes anciens afin de mieux comprendre l’évolution humaine et ses implications pour la biologie et la santé. Le ou la candidat·e bénéficiera d’un environnement de travail favorisant les analyses génomiques à grande échelle et le développement d’outils informatiques.

Rémunération et avantages

Rémunération : A partir de 3 237 € brut mensuel selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR7592-STEPEY-001
Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement
Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

 

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