Évolution et Génétique

Virginie COURTIER-ORGOGOZO

Nos recherches portent sur les mutations responsables des changements évolutifs.

Nous utilisons une combinaison de diverses approches pour identifier les mutations responsables des changements évolutifs et pour reconstruire les événements évolutifs passés. Nous espérons que notre travail fournira des données nouvelles et rigoureuses pour mieux comprendre notre évolution, passée et future.

Mots-clés : évolution, espèces, drosophile, génome, génétique, écologie, bioadhésif, développement, QTL mapping

 

+33 (0)157278043     virginie.courtier(at)ijm.fr     @Biol4Ever       https://courtier.ijm.fr/

Notre objectif est de comprendre comment et pourquoi certains traits de caractère apparaissent au cours de l’évolution.

Nous utilisons toutes les approches disponibles (génomique, biologie du développement, biochimie, tests comportementaux, génétique, etc.) pour aborder le problème.

EVOLUTION DE LA COLLE DE DROSOPHILE (PI: V. COURTIER-ORGOGOZO)

À la fin du stade larvaire, les larves de drosophile produisent une colle protéique qui permet à l’animal d’adhérer à un substrat pendant plusieurs jours au cours de la métamorphose. Nous souhaitons utiliser les puissants outils génétiques de l’organisme modèle Drosophila melanogaster pour explorer les bases moléculaires de l’adhésion à la colle des mouches. Nous voulons identifier les gènes impliqués dans l’adhésion de la colle et comprendre comment ils ont changé au cours de l’évolution pour permettre à la colle d’adhérer à divers substrats dans divers environnements. Nous avons développé un nouveau test pour quantifier l’adhésion de la colle de drosophile et nous prévoyons de mesurer l’adhésion de divers mutants et de comparer l’adhésion entre différentes populations de Drosophila melanogaster et espèces de drosophile.

 

EVOLUTION DE L’ASYMMETRIE GAUCHE-DROITE (PI: MICHAEL LANG)

Comment des asymétries gauche-droite de taille des organes se mettent en place au cours du développement reste un mystère. Drosophila pachea a développé une asymétrie gauche-droite unique dans les lobes de ses organes génitaux. Aucune asymétrie de taille gauche-droite n’a été décrite chez D. melanogaster. Nous essayons de découvrir les mécanismes qui déterminent le développement asymétrique des lobes et le rôle de ces lobes asymétriques pendant la copulation. Nous utilisons un stock de Drosophila pachea contenant des mâles mutants symétriques spontanés et nous effectuons des ablations-laser des soies des lobes. Nous examinons également l’effet de cette asymétrie gauche-droite sur le comportement. Nous analysons des espèces proches de D. pachea afin de comprendre comment l’asymétrie gauche-droite de taille des lobes a évolué chez D. pachea.

 

 

 

EVOLUTION DES PARTIES GÉNITALES (PI: V. COURTIER-ORGOGOZO)

Nous souhaitons comprendre comment la morphologie des organes génitaux change rapidement au cours de l’évolution. Nous combinons des études de biologie du développement, génomique, génétique, génétique quantitative, génétique des populations, microchirurgie au laser et des expériences comportementales pour comprendre comment les gènes et les mécanismes cellulaires modulent la forme des organes de manière subtile et précise, et comment cela peut affecter la reproduction et l’évolution à long terme. Nous examinons les organes génitaux suivants : les soies hypandriales, les branches ventrales et les lobes postérieurs.

 

 

 

THE ORIGIN OF COVID-19

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BASES DE DONNÉES

 

Gephebase contient une liste de tous les gènes et mutations qui ont été identifiés comme contribuant à des différences phénotypiques (traits morphologiques, physiologiques et comportementaux) entre populations ou espèces pour les organismes pluricellulaires.

Article associé : Courtier-Orgogozo V, Martin A, Arnoult L, Prigent S, Wiltgen S (2020) Gephebase, a Database of Genotype-Phenotype Relationships for natural and domesticated variation in Eukaryotes. Nucleic Acid Research 48(D1), D696-D703. doi:10.1093/nar/gkz796 PDF HAL

 

FlyPhenomics fournit une compilation des phénotypes qui ont été rapportés comme différant entre au moins deux espèces du sous-groupe D. melanogaster. Plus de 150 différences morphologiques, physiologiques et comportementales ont été décrites entre 1919 et 2006.

Article associé : Orgogozo V, Stern DL, How different are recently diverged species ? Plus de 150 différences phénotypiques ont été signalées pour le sous-groupe d’espèces D. melanogaster. Fly 2009 Mar-Apr;3(2):117.

FlyPNS : description du système nerveux périphérique embryonnaire et larvaire de D. melanogaster. Réalisé avec Wesley Grueber.

Article associé : Orgogozo V, Grueber WB, FlyPNS, a database of the Drosophila embryonic and larval peripheral nervous system. BMC Dev Biol. 2005 Feb 17; 5(1):4.

Responsable :

Virginie COURTIER-ORGOGOZO

Directrice de Recherche 2e classe

Téléphone : +33 (0)157278043+33 (0)157278087

virginie.courtier(at)ijm.fr

 

Membres de l’équipe :

Manon MONIER, PhD student

manon.monier(at)ijm.fr

Arrived in March 2020 for her M2

Evolution of Drosophila glue.

 

Michael LANG, CNRS CR researcher

michael.lang(at)ijm.fr

Arrived in May 2010

Evolution of left-right asymmetry in D. pachea and closely related species.

Evolution of sterol metabolism in insects.

 

Alexis LALOUETTE, University lecturer

alexis.lalouette(at)ijm.fr

Arrived in 2011

Development and evolution of lobe shape in the D. melanogaster subgroup.

 

Isabelle NUEZ, Research Engineer CNRS

isabelle.nuez(at)ijm.fr

Arrived in 2011

Evolution of genitalia bristles in D. santomea. Evolution of Drosophila glue.

 

Jean-Noël LORENZI, Research Engineer CNRS

jeannoel.lorenzi(at)gmail.com

Arrived in Sept 2021

Elucidating the proximal origin of SARS-CoV-2.

 

Roshan Kumar VIJENDRAVARMA, CNRS CR researcher

Arrived in Jan 2022
Developmental instability and sexual selection, adaptation to chronic malnutrition during development.

van Helden, J., Butler, C. D., Achaz, G., Canard, B., Casane, D., Claverie, J. M., … & Halloy, J. (2021). An appeal for an objective, open, and transparent scientific debate about the origin of SARS-CoV-2. The Lancet.    Featured in several newspapers including   il Fatto Quotidiano Daily Mail ThePrint   

Peluffo AE, Hamdani M, Vargas-Valderrama A, David JR, Mallard F, Graner F, Courtier-Orgogozo V. A morphological trait involved in reproductive isolation between Drosophila sister species is sensitive to temperature. Ecology and Evolution 11(12), 7492-7506. doi: 10.1002/ece3.7580 DRYAD Supp Data BioRxiv 

Borne, F., Prigent, S.R., Molet, M., Courtier-Orgogozo, V. (2021) Drosophila glue protects from predation. Proc. R. Soc. B. 288: 20210088. doi: 10.1098/rspb.2021.0088 DRYAD Supp Data  BioRxiv
Actualité CNRS

Lefèvre, B.M., Catté, D., Courtier-Orgogozo, V., Lang, M. (2021) Male genital lobe morphology affects the chance to copulate in Drosophila pacheaBMC Ecol Evo 21, 23. doi: 10.1186/s12862-021-01759-z PDF

Rode N, Courtier-Orgogozo V, Débarre F. (2020) Can a population targeted by a CRISPR-based homing gene drive be rescued? G3. 10 (9), 3403-3415. doi: 10.1534/g3.120.401484 BioRxiv

Courtier-Orgogozo V, Danchin A, Gouyon PH, Boëte C (2020) Evaluating the Probability of CRISPR-based Gene Drive Contaminating Another Species. Evolutionary Applications 00:1–18. doi: 10.1111/eva.12939 BioRxiv PDF

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Borne F, Kovalev A, Gorb S, Courtier-Orgogozo V (2020) The glue produced by Drosophila melanogaster for pupa adhesion is universal. Journal of Experimental Biology 223: jeb220608 doi: 10.1242/jeb.220608 Published 23 April 2020. DRYAD BioRxiv Featured in “inside JEBPDF
Passion Entomologie

Courtier-Orgogozo V, Martin A (2020) The Coding Loci of Evolution and Domestication: Current Knowledge and Implications for Bio-Inspired Genome Editing. Journal of Experimental Biology 223: jeb208934. Published 7 February 2020. doi: 10.1242/jeb.208934  PDF  HAL

Prigent S, Lang M, Nagy O, Acurio A, Matamoro-Vidal A, Courtier-Orgogozo and David JR (2020) Field collections reveal that São Tomé is the Afrotropical island with the highest diversity of drosophilid flies (Diptera: Drosophilidae). Annales de la Société Entomologique de France. doi:10.1080/00379271.2019.1703814 PDF HAL

Courtier-Orgogozo V, Martin A, Arnoult L, Prigent S, Wiltgen S (2020) Gephebase, a Database of Genotype-Phenotype Relationships for natural and domesticated variation in Eukaryotes. Nucleic Acid Research 48(D1), D696-D703. doi:10.1093/nar/gkz796 PDF HAL BioRxiv

Gavin Rice, Jean R. David, Yoshitaka Kamimura, John P. Masly, Alistair P. Mcgregor, Olga Nagy, Stéphane Noselli, Maria Daniela Santos Nunes, Patrick O’Grady, Ernesto Sánchez-Herrero, Mark L. Siegal, Masanori J. Toda*, Mark Rebeiz*, Virginie Courtier-Orgogozo*, Amir Yassin* (*: corresponding authors) (2019). Revised nomenclature and atlas of the male terminalia of Drosophila melanogasterFly. doi:10.1080/19336934.2019.1653733 PDF HAL preprints 

2021

Borne F, Kulathinal RJ, Courtier-Orgogozo V. (2021) Glue genes are subjected to diverse selective forces during Drosophila development. Genome Biology and Evolution. evab248. doi: 10.1093/gbe/evab248 PDF  DRYAD BioRxiv.
EntomoNews

 

Suvorov, A., Kim, B. Y., Wang, J., Armstrong, E. E., Peede, D., D’Agostino, E. R., Price, D.K., Waddell, P., Lang, M., Courtier-Orgogozo, V., David, J.R., Petrov, P., Matute, D.R., Schrider, D.R., Comeault, A. A. (2021) Widespread introgression across a phylogeny of 155 Drosophila genomes. Current Biology 32, 1-13. doi:10.1016/j.cub.2021.10.052
BioRxiv

van Helden, J., Butler, C. D., Achaz, G., Canard, B., Casane, D., Claverie, J. M., … & Halloy, J. (2021). An appeal for an objective, open, and transparent scientific debate about the origin of SARS-CoV-2. The Lancet.    Featured in several newspapers including   il Fatto Quotidiano Daily Mail ThePrint   

Peluffo AE, Hamdani M, Vargas-Valderrama A, David JR, Mallard F, Graner F, Courtier-Orgogozo V. A morphological trait involved in reproductive isolation between Drosophila sister species is sensitive to temperature. Ecology and Evolution 11(12), 7492-7506. doi: 10.1002/ece3.7580 DRYAD Supp Data BioRxiv 

Borne, F., Prigent, S.R., Molet, M., Courtier-Orgogozo, V. (2021) Drosophila glue protects from predation. Proc. R. Soc. B. 288: 20210088. doi: 10.1098/rspb.2021.0088 DRYAD Supp Data  BioRxiv
Actualité CNRS

Lefèvre, B.M., Catté, D., Courtier-Orgogozo, V., Lang, M. (2021) Male genital lobe morphology affects the chance to copulate in Drosophila pacheaBMC Ecol Evo 21, 23. doi: 10.1186/s12862-021-01759-z PDF

2020

Rode N, Courtier-Orgogozo V, Débarre F. (2020) Can a population targeted by a CRISPR-based homing gene drive be rescued? G3. 10 (9), 3403-3415. doi: 10.1534/g3.120.401484 BioRxiv

Courtier-Orgogozo V, Danchin A, Gouyon PH, Boëte C (2020) Evaluating the Probability of CRISPR-based Gene Drive Contaminating Another Species. Evolutionary Applications 00:1–18. doi: 10.1111/eva.12939 BioRxiv PDF

Borne F, Kovalev A, Gorb S, Courtier-Orgogozo V (2020) The glue produced by Drosophila melanogaster for pupa adhesion is universal. Journal of Experimental Biology 223: jeb220608 doi: 10.1242/jeb.220608 Published 23 April 2020. DRYAD BioRxiv Featured in “inside JEBPDF
Passion Entomologie

Courtier-Orgogozo V, Martin A (2020) The Coding Loci of Evolution and Domestication: Current Knowledge and Implications for Bio-Inspired Genome Editing. Journal of Experimental Biology 223: jeb208934. Published 7 February 2020. doi: 10.1242/jeb.208934  PDF  HAL

Prigent S, Lang M, Nagy O, Acurio A, Matamoro-Vidal A, Courtier-Orgogozo and David JR (2020) Field collections reveal that São Tomé is the Afrotropical island with the highest diversity of drosophilid flies (Diptera: Drosophilidae). Annales de la Société Entomologique de France. doi:10.1080/00379271.2019.1703814 PDF HAL

Courtier-Orgogozo V, Martin A, Arnoult L, Prigent S, Wiltgen S (2020) Gephebase, a Database of Genotype-Phenotype Relationships for natural and domesticated variation in Eukaryotes. Nucleic Acid Research 48(D1), D696-D703. doi:10.1093/nar/gkz796 PDF HAL BioRxiv

2019

Fly-genitalia-atlas-CoverGavin Rice, Jean R. David, Yoshitaka Kamimura, John P. Masly, Alistair P. Mcgregor, Olga Nagy, Stéphane Noselli, Maria Daniela Santos Nunes, Patrick O’Grady, Ernesto Sánchez-Herrero, Mark L. Siegal, Masanori J. Toda*, Mark Rebeiz*, Virginie Courtier-Orgogozo*, Amir Yassin* (*: corresponding authors) (2019). Revised nomenclature and atlas of the male terminalia of Drosophila melanogasterFly. doi:10.1080/19336934.2019.1653733 PDF HAL preprints 

Matentzoglu, Nicolas, Balhoff, James P., Bello, Susan M., Bradford, Yvonne M., Carmody, Leigh C., Cooper, Laurel D., Courtier-Orgogozo V., … Osumi-Sutherland, David. (2019, July 26). Phenotype Ontologies Traversing All The Organisms (POTATO) workshop: 2nd edition. Zenodo

Acurio A, Rhebergen FT, Paulus S, Courtier-Orgogozo V, Lang M (2019) Repeated evolution of asymmetric genitalia and one-sided mating in the Drosophila nannoptera species group. BMC Evolutionary Biology 19:109. doi:10.1186/s12862-019-1434-z  HAL PDF bioRxiv

Pondeville E, Puchot N, Lang M, Cherrier F, Schaffner F, Dauphin-Villemant C, Bischoff E, and Bourgouin C (2019) Evolution of sexually-transferred steroids and mating-induced phenotypes in Anopheles mosquitoes. Science Reports 2019, 9:4669.

Rode NO, Estoup A, Bourguet D, Courtier-Orgogozo V, Débarre F (2019) Population management using gene drive: molecular design, models of spread dynamics and assessment of ecological risks. Conservation Genetics, 20: 671–690. PDF Zenodo

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Da Lage JL, Thomas GWC, Bonneau M, Courtier-Orgogozo V (2019) Evolution of salivary glue genes in Drosophila species. BMC Evolutionary Biology 19:36. PDF bioRxiv

2018

Nagy O, Nuez I, Savisaar R, Peluffo AE, Yassin A, Lang M, Stern DL, Matute DR, David JR, Courtier-Orgogozo V. Correlated Evolution of two Copulatory Organs via a Single Cis-Regulatory Nucleotide Change. Current Biology 28(21):3450-3457.e13. doi: 10.1016/j.cub.2018.08.047. Epub 2018 Oct 18. Supp Info FigShare PDF
HAL bioRxiv  Youtube video – CNRS news – La Recherche – Dispatch in Current Biology – F1000 Recommendation – OpenAccess

Matamoro-Vidal A, Tully T, Courtier-Orgogozo V, Robustness of bristle number to temperature and genetic background varies with bristle type and is regulated by miR-9abioRxiv

Courtier-Orgogozo V, Martin A, Predicting the genetic loci of past evolution. To be published in The culture of predictability and the nature of the unpredictable. Life, evolution, behaviour. Eds. Ceccarelli D, Frezza G. PDF Full Book bioRxiv

2017

Courtier-Orgogozo V, Morizot B, Boëte C, Using CRISPR‐based gene drive for agriculture pest control. EMBO reports 18, 1481. Reply to CommentsPDF 

Courtier-Orgogozo V, Morizot B, Boëte C, Agriculture Pest Control with CRISPR-based gene drive: Time for public debate. EMBO reports PDF 

Martin A, Courtier-Orgogozo V, Morphological evolution repeatedly caused by mutations in signaling ligand genes. Diversity and Evolution of Butterfly Wing Patterns : An Integrative Approach. Eds. Sekimura T, Nijout F. Springer. Book chapter Table S1 Table S2 PDF

2016
Rhebergen F, Courtier-Orgogozo V, Dumont J, Schilthuizen M, Lang M. (2016) Drosophila pachea asymmetric lobes are part of a grasping device and stabilize one-sided mating. BMC Evolutionary Biology, 16(1),176. HAL PDF

Orgogozo V, Peluffo A, Morizot B. (2016) The “Mendelian gene” and the “molecular gene”: two relevant concepts of genetic units. Current Topics in Developmental Biology 119:1-26. CTDB HAL PDF

Lang M, Nagy O, Lang C, Orgogozo V. (2016) High throughput preparation of fly genomic DNA in 96-well format using a paint-shaker. Fly 9(3):138-44. PubMed PDF

Pradeu T, Laplane L, Prévot K, Hoquet T, Reynaud V, Fusco G, Minelli A, Orgogozo V, and Vervoort M. (2016) Defining “development”. Current Topics in Developmental Biology 117:171-83. Link PDF

2015
Orgogozo, V. (2015). Replaying the tape of life in the twenty-first century. Interface Focus5(6), 20150057. Link PDF

Orgogozo, V, Morizot, B, & Martin, A (2015). The differential view of genotype–phenotype relationships. Frontiers in Genetics, 6, 179. PDF

Peluffo, A. E., Nuez, I., Debat, V., Savisaar, R., Stern, D. L., & Orgogozo, V. (2015). A Major Locus Controls a Genital Shape Difference Involved in Reproductive Isolation Between Drosophila yakuba and Drosophila santomea. G3: Genes| Genomes| Genetics, g3-115. PDF

passées : Alexandre Peluffo, Flora Borne

en cours : Manon Monier

International

  1. Andolfatto, Columbia University, USA
  2. Martin, Georges Washington University, USA
  3. Matute, Chicago University, USA
  4. Santos, University of Cambridge, Cambridge, UK
  5. Schilthuizen, Leiden, Netherlands
  6. D.L. Stern, Janelia farm, Ashburn, USA

National

  1. Danchin, Paris
  2. Graner, Université Paris 7, Paris
  3. Montagné and T. Chertemps, Université Paris 6, Paris
  4. Morizot, Marseille
  5. Rode, Montpellier
  6. Wiltgen, Montpellier

Labex “Who am I?”

CNRS MITI 2020-2021 Adaptation du vivant