Toutes les actualités de l'IJM depuis 2010

  • Une enzyme pas comme les autres fait taire les séquences répétées du génome

    Chez les plantes et les animaux, les protéines histones associées à l’ADN portent différentes modifications chimiques qui répriment soit l’expression des gènes, soit les éléments génétiques mobiles. L’équipe de Sandra Duharcourt vient de caractériser les propriétés inédites d’une enzyme de l’eucaryote unicellulaire Paramecium qui catalyse deux modifications silencieuses différentes et contrôle le silence des éléments transposables. Ces travaux, publiés dans la revue Nature Communications, révèlent que ces deux modifications partagent un rôle ancestral commun qui réduit au silence les éléments transposables.

  • Le prix Nicloux 2019 a été attribué à Odil Porrua

    La Société Française de Biochimie et Biologie moléculaire a remis le Prix Maurice Nicloux 2019 à Odil Porrua, chargée de recherche CNRS, membre de l'Institut Jacques Monod. Odil Porrua s’intéresse depuis le début de sa carrière à différents aspects de l’expression des gènes. De 2005 à 2009, Odil a effectué sa thèse dans le laboratoire de E. Santero (Espagne) où elle a étudié la régulation de certains gènes impliqués dans la dégradation de molécules contaminantes chez la bactérie.En 2009, Odil a rejoint le laboratoire de Domenico Libri, d’abord au Centre de Génétique Moléculaire (Gif sur Yvette) puis à l’Institut Jacques Monod (Paris) à partir de 2013. D’abord comme post-doc puis comme chercheur CNRS, Odil a conduit plusieurs projets autour du métabolisme des ARN non-codants chez la levure. Notamment par des approches biochimiques et structurales, elle a pu dévoiler les mécanismes de terminaison de la transcription non-codante qui étaient alors très peu connus. Deux ans après avoir obtenu son poste de chercheur CNRS, en 2014, et grâce à un financement ANR JCJC, Odil a abordé l’étude du rôle de la terminaison de la transcription dans la régulation de l’expression de gènes.

  • Juin 2019 : Les fluctuations de la condensation de la chromatine plutôt que sa condensation moyenne prédisent l'accessibilité de la chromatine

    L'accessibilité de la chromatine aux facteurs protéiques est essentiel pour les activités du génome. Cependant, les propriétés dynamiques des super-structures de la chromatine qui régulent son accessibilité sont mal comprises. Les chercheurs de l’équipe « Mécanotransduction : de la surface de la cellule à son noyau » ont tiré parti de la sensibilité au microenvironnement de la durée de vie de fluorescence de l’histone EGFP-H4 incorporée dans la chromatine pour cartographier dans le noyau des cellules vivantes la dynamique de la condensation de la chromatine et son interaction directe avec un domaine de reconnaissance de l’acétylation des queues des histones (le module du double bromodomaine du facteur de transcription TAFII250, dBD). Ils ont révélé des fluctuations de condensation de la chromatine, causées par des mécanismes fondamentalement distincts de ceux de la condensation elle-même. Ces fluctuations sont spontanées, mais leurs amplitudes sont influencées par leur localisation dans le noyau et par des mécanismes concurrents dépendant de l'acétylation des histones, de l'ATP et des deux. De plus, l'accessibilité de l'histone H4 acétylée au dBD n'est pas limitée par la condensation de la chromatine ni prédite par l'acétylation, mais par les fluctuations de la condensation de la chromatine.

  • Mars 2019 : Le contrôle temporel de la réplication de l’ADN est-il constant tout au long de la phase S ?

    Avant chaque division cellulaire, le génome complet de la cellule doit être entièrement et fidèlement dupliqué pour que l’intégralité de l’information génétique soit transmise à chacune des cellules filles. Cette duplication s’effectue selon un programme de réplication complexe pendant la relativement brève phase de synthèse (phase S). La réplication démarre en de multiples sites du génome appelés origines de réplication. Ces sites sont au nombre de dizaines de milliers dans les génomes de vertébrés. Leur déclenchement est organisé dans le temps. Ainsi certaines régions sont répliquées en début, milieu ou fin de phase S. Le contrôle du moment de réplication de ces régions est très conservé dans l’ensemble des cellules d’une population. A ce jour, les mécanismes et les facteurs moléculaires responsables de l’établissement de ce contrôle restent très peu connus. Les chercheurs de l’équipe de Marie-Noëlle Prioleau se sont intéressés à évaluer le degré de variabilité de ce programme temporel pour identifier les mécanismes potentiels impliqués dans cette régulation.

  • Janvier 2019 : quand Transcription rencontre Réplication

    Comment les cellules font-elles face à leurs propres contradictions? Pour assurer l'expression, le maintien et la propagation de son génome, la cellule doit mettre en place des activités enzymatiques potentiellement conflictuelles, la transcription et la réplication. Dans un article récemment publié dans la revue eLife, les chercheurs de l’équipe Libri montrent, chez la levure S. cerevisiae, que les facteurs de réplication se liant à l'ADN pour définir les endroits d'où la réplication est initiée, "protègent" également ces sites de la transcription avoisinante, qu'ils terminent. Et que les niveaux faibles de transcription qui néanmoins envahissent ces sites, influencent l'activité de réplication.

  • Janvier 2019 : Adaptation de la forme cellulaire à la géométrie de son environnement pour migrer.

    La migration cellulaire est un mécanisme primordial qui assure des fonctions essentielles telles que la mise en place des tissus et des organes au cours du développement ou encore la cicatrisation des tissus endommagés.

  • Janvier 2019 : Les Facteurs Généraux de la Régulation : Gardiens de la fidélité de la transcription

    Qu’est-ce qu’un facteur de transcription ? Le facteur de transcription est une protéine capable de se lier aux promoteurs des gènes afin d’assurer leur régulation en favorisant ou limitant l’initiation de la transcription. Et si ces facteurs étaient capables d’activer l’expression des gènes en empêchant l’initiation de la transcription ?

  • Janvier 2019 : Comment le contexte geométrique et mécanique affecte le désassemblage des filaments d’actine

    Dans un article récemment paru dans P.N.A.S., les chercheurs de l’équipe « régulation de la dynamique d’assemblage de l’actine » à l’Institut Jacques Monod montrent comment le désassemblage biochimique des filaments d’actine peut être régulé par leur contexte physique.

  • Janvier 2019 : Liens entre la localisation des protéines de polarité, le trafic membranaire et le cytosquelette

    La polarité cellulaire est une caractéristique essentielle du développement et du fonctionnement d'un organisme. Elle permet la subdivision de la cellule en différents domaines fonctionnels, tant au niveau de la membrane plasmique que du cytoplasme, assurant une asymétrie dans les fonctions de la cellule. L'établissement et le maintien de la polarité cellulaire sont sous le contrôle de deux principaux modules protéiques bien conservées parmi les métazoaires, incluant respectivement PAR1 et PAR3.

  • 29 décembre 2018 : décès de Jacques Ricard

    C’est avec un grand regret que nous avons appris le décès le 29 décembre dernier de Jacques Ricard qui fut directeur de l’Institut Jacques Monod de 1992 à 1996 et professeur d’Enzymologie à l’Université Paris-Diderot. Il a été également directeur du Centre de Biochimie et de Biologie Moléculaire du CNRS à Marseille de 1980 à 1991, membre de l’Académie Internationale de Philosophie des Sciences et membre correspondant de l’Académie des Sciences. Nous lui devons en particulier d’avoir structuré l’Institut Jacques Monod en départements, qui fut le mode de fonctionnement jusqu’en 2008 et d’avoir été l’artisan d’une orientation « Biologie cellulaire » forte à l’Institut. Ses travaux ont été fondateurs dans le domaine de l’enzymologie, notamment en ce qui concerne la régulation des enzymes via leurs interactions avec leurs substrats et métabolites ainsi que leur environnement cellulaire.

  • Décembre 2018 : BUB-1, une kinase aux multiples fonctions

    Dans un article paru en Décembre dans eLife, l’équipe Dumont de l’Institut Jacques Monod démontre que la protéine kinase BUB-1 contrôle la ségrégation des chromosomes en modulant l’activité de plusieurs protéines aux kinétochores. De manière inattendue, ce rôle de BUB-1 est indépendant de son activité kinase.

  • Novembre 2018 : Comprendre la régénération chez les animaux, l’apport de l’annélide Platynereis

    La capacité qu’ont certains animaux à régénérer des parties importantes de leur corps après une blessure ou une amputation, fascine les biologistes depuis des siècles. L’annélide Platynereis dumerilii fait partie de ces animaux ayant des capacités remarquables de régénération. Ce ver marin est en effet capable de reformer diverses parties de son anatomie suite à une amputation, notamment ses appendices et la partie caudale de son corps. Cette dernière comprend à la fois des structures différenciées variées et des cellules souches responsables de la croissance de l’animal. Dans un article publié ce mois-ci dans Developmental Biology, Anabelle Planques et d’autres membres de l’équipe « Cellule souches, Développement et Evolution » de l’Institut Jacques Monod, en collaboration avec un chercheur de l’Université de La Corogne (Espagne), ont caractérisé la régénération caudale de Platynereis. Ils ont montré qu’il s’agit d’un processus très rapide, qui requiert de la prolifération cellulaire et pendant lequel sont exprimés plusieurs gènes connus dans divers modèles pour leur expression dans des cellules souches. L’origine des cellules participant à la régénération des structures manquantes a été également partiellement dévoilée, suggérant un rôle majeur de la dédifférenciation de cellules adjacentes au plan d’amputation. Cette étude pionnière de la régénération chez Platynereis pose les fondements pour l’identification des mécanismes contrôlant ce processus chez cette espèce et ouvre de nouvelles perspectives pour la compréhension de son évolution à l’échelle des animaux.

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