Biologie computationnelle et biomathématiques

Responsable

  • Khashayar PAKDAMAN
    Téléphone : +33 (0)157278054
    Courriel
    3e étage

Thèmes et axes de recherche : Biologie quantitative et modélisation

Notre équipe s'intéresse aux systèmes biologiques à partir d’une approche interdisciplinaire fondée sur l’interaction des mathématiques, de l'informatique et de la biologie. Notre stratégie est fondée sur l'analyse de données conduisant à l'étude et l'élaboration de modèles informatiques, et mathématiques permettant de décrire et de prévoir la dynamique des phénomènes qui nous intéressent. Les méthodes mathématiques utilisées pour étudier ces modèles sont très variées et font intervenir aussi bien la théorie des systèmes dynamiques, des équations aux dérivées partielles que les probabilités.
L'équipe est impliquée dans l'organisation de nombreuses conférences scientifiques et  la compilation de deux numéros spéciaux de la revue Networks and Heterogenous Media [1,2].

L'équipe a un engagement fort dans l'enseignement, l'innovation pédagogique et la formation à et par la recherche, reconnu par un prix "High Performance Computing for Education"  Microsoft en 2008, et elle est labélisée "Cuda Teaching Center" depuis 2011.
Elle est fortement impliquée dans la diffusion de la culture scientifique par des approches créatives combinant art et sciences (Festival Sciences sur Seine 2008).

[1] Henri Berestycki,  Danielle Hilhorst,  Frank Merle,  Masayasu Mimura and Khashayar Pakdaman (special issue editors) Networks and heterogenous media, special issue vol 7 (4) December 2012.
[2] Henri Berestycki,  Danielle Hilhorst,  Frank Merle,  Masayasu Mimura and Khashayar Pakdaman (special issue editors) Networks and heterogenous media, special issue vol 8 (1) January 2013.

Sélection de publications

Guevara H. E.
Breakdown of the Finite-Time and -Population Scalings of the Large-Deviation Function in the Large-Size Limit of a Contact
Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment, (2018)
Abstract

Garcia del Molino L.C., Pakdaman K, Touboul J., Wainrib G.
The real Ginibre ensemble with k = O(n) real eigenvalues.
Journal of Statistical Physics. 18 fev. 2016.
Abstract

Le Cunff Y., Baudisch, A. Pakdaman K.
Evolution of Aging: Individual life History trade-offs and population Heterogeneity 
account for mortality patterns across species
Journal of Evolutionary Biology. 2014 Aug;27(8):1706-20 Jun 13.
Abstract

Pakdaman K., Perthame B., and Salort D.
Relaxation and self-sustained oscillations in the time Elapsed neuron Network Model.
SIAM Journal on Applied Mathematics 2013, 73(3), 1260–1279.
Abstract

Pakdaman K., Thieullen, M., Wainrib G.
Asymptotic expansion and central limit theorem for multiscale piecewise deterministic Markov processes.
Stochastic Processes and their Applications, 2012, 122 (6): 2292-2318. 
Abstract
 
Grotta-Ragazzo C., Malta C. P. and Pakdaman K.,
Metastable Periodic Patterns in Singularly Perturbed Delayed Equations.
Journal of Dynamics and Differential Equations, 2010, 22(2): 203-252
Abstract

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