Domaines chromatiniens et réplication

Au cours du développement, des domaines chromosomiques d'expression se structurent alors que les cellules se divisent activement. Avant chaque division, les cellules doivent copier leur génome le plus fidèlement possible sous peine d'arrêt de la division ou d'établissement de cellules cancéreuses. Ce processus se nomme la réplication de l'ADN et démarre en de multiples sites spécifiques, appelés origines de réplication. Un programme spatio-temporel contrôle le positionnement et le moment d'activation des origines de réplication au cours de la phase S du cycle cellulaire. Les mécanismes moléculaires qui mettent en place ce programme sont encore peu déchiffrés. Le but du laboratoire est d'en identifier les règles.

Afin d'avoir une vision générale de la réplication du génome humain, nous développons des analyses à  haut débit (puces à  ADN et séquençage massif) visant à  cartographier les origines de réplication ainsi que leur moment d'activation. Ces données génomiques nous permettent d'identifier des règles générales qui gouvernent le programme spatio-temporel de la réplication. Nous utilisons également un modèle cellulaire aviaire (la lignée DT40) qui a la propriété unique d'effectuer très efficacement la recombinaison homologue. Ce modèle génétique puissant nous permet de tester les hypothèses extraites des analyses génomiques.

La compréhension du mode de duplication des génomes eucaryotes est essentielle. En effet, la réplication assure non seulement le maintien de l'intégrité des génomes, mais également coordonne la mise en place de programmes d'expression au cours du développement.

Image d'une puce à  ADN obtenue après co-hybridation de petits brins naissants, marqueurs des origines de réplication, (rouge) et d'ADN génomique (vert). Environ 300 origines de réplication ont été identifiées sur 1% du génome humain (44 régions discrètes de 500 Kb à  2 Mb choisies par le consortium ENCODE). Le profil d'enrichissement obtenu sur une partie du locus Hox A est montré avec en dessous schématisés les origines de réplication ainsi que les gènes

 L'équipe est labellisée par la Ligue nationale contre le cancer.

Sélection de publications

Genomic approaches to the initiation of DNA replication and chromatin structure reveal a complex relationship.
Meisch F, Prioleau MN.
Brief Funct Genomics. 2011 Jan;10(1):30-6. Epub 2011 Jan 28.
Abstract

Interplay between DNA replication and gene expression: a harmonious coexistence.
Maric C, Prioleau MN.
Curr Opin Cell Biol. 2010 Jun;22(3):277-83. Epub 2010 Apr 2. Review.
Abstract

Genome-wide approaches to determining origin distribution.
Cadoret JC, Prioleau MN.
Chromosome Res. 2010 Jan;18(1):79-89.
Abstract

The relationship between DNA replication and human genome organization.
Necsulea A, Guillet C, Cadoret JC, Prioleau MN, Duret L.
Mol Biol Evol. 2009 Apr;26(4):729-41. Epub 2009 Jan 6.
Abstract

Genome-wide studies highlight indirect links between human replication origins and gene regulation.
J-C. Cadoret, F. Meisch, V. Hassan-Zadeh, I. Luyten, C. Guillet, L. Duret, H. Quesneville & M-N. Prioleau
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (2008), October 6, 2008
Abstract

Dernière modification 9/09/2011

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