Modules 2006-07

Sommaire

• Modules de 2000 à  2006
• Modules 2006-07

Objectif :
Ce module a pour but d'introduire les techniques de microscopie de fluorescence en émergence qui permettent l'analyse spatio-temporelle, au niveau sub-cellulaire, des interactions entre macromolécules biologiques et leur dynamique, et d'introduire la micromanipulation des cellules et des objets biologiques par pinces optiques. Les aspects théoriques (fluorescence, microscopies, mesures de forces) seront abordés de façon pragmatique en insistant sur les méthodologies (utilisation des protéines auto fluorescentes, GFP et variants Spectraux).
Des exemples, tirés d'articles récents, seront choisis et discutés pour garder un caractère dynamique et rester proche de problématiques biologiques.

Public :
Ce module de formation s'adresse aux étudiants en thèse en biologie ou à  l'interface physique-biologie.
12 étudiants sont sélectionnés pour la phase pratique au moment de leur inscription à  ce module. Il n'y a pas de sélection pour la phase théorique pour laquelle une attestation d'enseignement correspondant à  20h de cours est délivrée.
 

Programme :
· Partie théorique:
- pourquoi utiliser la fluorescence pour l'étude de la cellule vivante? (bases physiques de la fluorescence ; la GFP et ses variants)
- la fluorescence en microscopie (Microscopie confocale i et 2-photon)
- micromanipulation et mesure de forces par pinces optiques
- Dynamique des macromolécules et interactions en cellules vivantes (FRAP, FLIP, Tracking, FCS, FRET)
· Partie pratique:
- Confocal et FRAP : mobilité translationnelle de protéine dans divers compartiments subcellulaires
- FRET (interaction protéine-protéine en cellule vivante) par FLIM
- Microscopie Multifocale Monophoton (Spinning wheel) et Multiphoton (TriMscope) : dynamiques subcellulaires des macromolécules au sein d'embryons et de tissus.

Télécharger le programme (.pdf)

Encadrement :
· Responsable :
Maïté Coppey (Institut Jacques Monod)

· Intervenants pressentis
Partie théorique : François Amblard (IC, Paris); Maïté Coppey (IJM, Paris); Valentina Emiliani; François Gallet (LPTH, Paris); Didier Marguet (CIML, Marseille); Martin Oheim (ESPCI, Paris); Laurent Groc (Institut François Magendie, Bordeaux); Marc Tramier (IJM, Paris); Yves Usson (TIMC et IN3S, Grenoble).
Partie pratique : Christophe Chamot (IJM); Maïté Coppey (IJM); Christiane Durieux (IJM); Aude Jobart (IJM); Tristan Piolot (IJM), Marc Tramier (IJM).

Organisation :
Durée : 5 jours (du lundi 4 au vendredi 8 décembre 2006)
Lieu : Institut Jacques Monod, 2 place Jussieu - tour 43, 75005 Paris

Objectif :
Présenter les principes, spécificités, avantages, limites, et les principales applications de la cytométrie en flux au travers d'exemples concrets tirés de la littérature et de l'expérience des intervenants.

Public :
Ce module de formation s'adresse principalement aux étudiants en thèse de biologie.
16 étudiants peuvent participer à  la partie pratique, il n'y a pas de nombre limite pour la partie théorique. Une attestation de participation est délivrée au prorata de la durée de la participation.

Date limite d'inscription :  mercredi 31 janvier 2007.
Inscription par e-mail auprès de :
Colette Kanellopoulos ou Marie Claude Gendron

Programme : (à  confirmer)
· Partie théorique:
- La cytométrie en flux : principes de l'analyse, du tri et applications.
- Du bon usage de la cytométrie en flux
- Analyse du cycle par cytométrie en flux: utilisation des marqueurs du cycle cellulaire et méthodes de synchronisation.
- Utilisation de la cytométrie en flux pour la détection de l'apoptose
- Analyses moléculaires multiplexées par cytométrie en flux
- Caractérisation phénotypique et fonctionnelle des cellules souches
- La Green Fluorescent Protein et ses variants pour la Cytométrie en Flux
- Cytométrie en flux microbienne

. Partie pratique:
- marquage multi-couleurs de cellules : de l'élaboration du protocole au tri de sous-populations (standardisation, réglages, contrôles, compensations …).
- analyse du cycle cellulaire

Encadrement :
· Responsables : (Institut Jacques Monod)
Colette Kanellopoulos-Langevin et Marie Claude Gendron

Intervenants pressentis :
Partie théorique :
Karim Benihoud (UMR 8121 Villejuif),
Marie Claude Gendron (IJM, Paris),
Colette Kanellopoulos (IJM, Paris),
Gérard Lizard (INSERM U498 Dijon),
J.F Mayol (CRSSA, La Tronche),
et 2 autres orateurs à  confirmer.

Organisation :
Durée : 4 jours en mars 2007 (dates à  confirmer)
Lieu : Institut Jacques Monod, 2 place Jussieu - tour 43, 75005 Paris

Objectif :
Permettre aux étudiants une prise en main rapide du système instrumental Biacore 2000 mis en ?uvre au sein de la Plateforme « Protéomique » de l'Institut Jacques Monod.
Pour cela, le module est organisé sous la forme de sessions de 2 jours pour des groupes de 2 étudiants.

Public :
Le module « Analyse des interactions moléculaires par Résonance Plasmonique de Surface (Biacore) » est ouvert aux étudiants inscrits en thèse quelque soit leur école doctorale de rattachement.
La capacité d'accueil maximale est de 10 étudiants par an.

Date limite d'inscription :
Il n'y a pas de date fixée par avance pour les sessions du module « Analyse des interactions moléculaires par Résonance Plasmonique de Surface (Biacore) ». Les dates des sessions sont fixées en fonction du calendrier d'utilisation du système, en concertation entre les étudiants et le responsable du service.

Du fait des mesures d'organisation spécifiques liées au tutorat, les secrétariats des écoles doctorales ne peuvent pas inscrire les étudiants à  ce module.
Seules les inscriptions réalisées directement auprès du responsable du module seront validées.

Encadrement :
Responsable : Jean-Michel Camadro

Programme :
La formation comprend une introduction aux principes des mesures réalisées par SPR et un enseignement pratique assuré sous la forme d'un tutorat directement sur le système instrumental.
Les expériences peuvent être réalisées sur des échantillons apportés par les étudiants (après étude préalable de la faisabilité des mesures envisagées).

Organisation :
Durée : 2 jours (à  fixer avec le responsable du module)
Lieu : Institut Jacques-Monod, 2 place Jussieu - tour 43, 75005 Paris