Épigénome et paléogénome

Co-responsable : Eva-Maria GEIGL

Tél. : 33 (0)157278132
geigl.eva-mariaATijm.univ-paris-diderot.fr


Nous étudions les mécanismes d'activation transcriptionnelle et de reprogrammation de la mémoire épigénétique chez les mammifères, en utilisant comme régulateur modèle le récepteur des glucocorticoïdes. Nous nous intéressons particulièrement aux mécanismes de déméthylation de l'ADN, de remodelage de la chromatine et de remplacement des histones nucléosomales canoniques par des variants d'histones, ainsi qu'à  la communication entre enhancer et promoteur. Nous étudions aussi comment la diversité des mécanismes se traduit par la diversité des réponses physiologiques aux glucocorticoïdes à  l'aide de souris transgéniques.

Copyright : CNRS/IJM Th. Grange

D'autre part, l’équipe « Paléogénome », dirigée par Eva-Maria Geigl, étudie l’évolution génétique à l’aide de la paléogénétique et la paléogénomique. Elle poursuit plusieurs volets de recherche.

1. Elle étudie les mécanismes aboutissant à la préservation de l’ADN dans les os des mammifères durant leur fossilisation.
2. Elle développe des nouvelles méthodes d’analyse d’ADN préservé dans les os fossiles ou en cours de fossilisation. Elle a développé une expertise dans l’établissement de procédures originales pour l’étude de l’ADN ancien, prévenir les contaminations, minimiser l’inhibition de la PCR et réduire les erreurs de l’amplification. Elle a également établi une approche différente pour la détection de l’ADN ancien dans des extraits fossiles même s’il n’est pas accessible à l’amplification par PCR.
3. Elle utilise les méthodes développées ainsi que les éclairages obtenus des processus de fossilisation et de diagénèse pour étudier la phylogéographie et la domestication des animaux depuis le Pléistocène jusqu’à nos jours.

 

Copyright : CNRS/IJM E. M. Geigl

Sélection de publications

Pruvost, M., T. Grange and E. M. Geigl (2005). "Minimizing DNA contamination by using UNG-coupled quantitative real-time PCR on degraded DNA samples: application to ancient DNA studies." Biotechniques 38(4): 569-75.
abstract

Thomassin, H., C. Kress and T. Grange (2004). "MethylQuant: a sensitive method for quantifying methylation of specific cytosines within the genome." Nucleic Acids Res 32(21).
abstract

Flavin, M., L. Cappabianca, C. Kress, H. Thomassin and T. Grange (2004). "Nature of the accessible chromatin at a glucocorticoid-responsive enhancer." Mol Cell Biol 24(18): 7891-901.
abstract

Thomassin, H., M. Flavin, M. L. Espinas and T. Grange (2001). "Glucocorticoid-induced DNA demethylation and gene memory during development." Embo J 20(8): 1974-83.
abstract

Geigl, E. M. (2001). "Inadequate use of molecular hybridization to analyze DNA in Neanderthal fossils." Am J Hum Genet 68(1): 287-91.
abstract

Dernière modification 9/09/2011

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