Génomique - Transcriptomique
Sommaire
Plate-forme Génomique - Transcriptomique de l'Institut Jacques-Monod.
La plate-forme est constituée de deux appareils à PCR quantitative en temps réel de type Light Cycler 1.5 Roche et d'un lecteur de puces à ADN Axon GenePix 4000B. Un microspectrophotomètre Nanodrop y est aussi disponible.
La PCR quantitative en temps réel permet de quantifier de manière fiable, sensible et spécifique des séquences d'ADN ou d'ARN, de caractériser les produits de PCR par des courbes de fusion et d'effectuer le génotypage de polymorphisme génétique impliquant un seul nucléotide (SNP).
Amplification curve
Melting peaks
Les puces à ADN permettent de mesurer en une seule étape les variations d'abondance d'un très grand nombre de séquences nucléiques. Elles peuvent être utilisées pour quantifier les ARNm exprimés par les cellules, analyser la distribution de protéines chromosomales le long du génome, étudier les amplifications et délétions de portions chromosomales ainsi que les polymorphismes génétiques.
La microspectrophotométrie permet de mesurer des spectres d'absorption pour des échantillons d'un très petit volume (1 µl).
Responsable scientifique : Thierry Grange, directeur de recherche, CNRS
Dernière modification 15/05/2012